根据《国务院关于进一步调整国务院部门（单位）所属学校管理体制和布局结构的决定》（国发〔1999〕26号），国防科工委继续管理其所属学校。

根据2008年3月15日第十一届全国人民代表大会第一次会议通过的《关于国务院机构改革的决定》，不再保留“国防科学技术工业委员会”的机构设定；将原国防科工委除核电管理以外的职责都纳入到新成立的中华人民共和国工业和信息化部，原国防科工委直属高校也相应转由中华人民共和国工业和信息化部直属管理。

排名不分先后，此处以中华人民共和国工业和信息化部首页“直属高校”名单顺序书写。