经过辛苦的奋战，胜利暴龙兽终于除掉黑暗势力之后，数码世界迎来一片和谐景象……而《数码之魂第一季》中的使魔兽正在前往黑暗势力集中营汇报情况……

当数码兽们返回创始村的时候，它们对龙之魂的秘密展开深入研究，它们发现能够解释龙之魂的数码兽只有人马兽和阿努比斯兽。于是，胜利暴龙兽召集众数码兽开会，选出新的组合来完成这个任务，而在一颗大树下，一只数码兽正在悄悄接近它们……