松田启人，稍微有点率真，是个极普通的国小五年级男生，现在最喜欢的东西就是数码暴龙。对他来说，与朋友玩数码暴龙的Card Game及在上课时偷偷地把自己创作的数码暴龙画在笔记簿上是最大的乐趣！那个就和某个地方的十分热爱数码暴龙的少年一样的启人，他竟在某日偶然得到了一样能把他的命运大大改变的神秘对象，那就是以往从未有人见过的不思议的蓝色的卡片蓝卡。因为蓝色的卡片的力量而变形的读卡机，就在把蓝卡放在读卡机读进去的瞬间，在启人的眼前冒险之门已经打开了。 在画面上显示出裂开了的数码蛋。之后从天空降下光柱。启人在心中有种确实的预感所以便前往光柱。在那里等待着启人的是，启人所想像出来的数码暴龙．基尔兽。启人欢喜地走向基尔兽，但是……

　　基尔兽吐出来的火焰竟把混凝土的墙壁开了个洞。启人想到自己也可能会遭到攻击而十分害怕，跟着的一剎那启人所看到的是……基尔兽天真无邪地向他笑。知道基尔兽并无敌意的启人，总算可以真正的安心下来。但是启人真正的麻烦现在才开始。把体形庞大的基尔兽隐藏实在是一大苦事。启人利用纸皮箱掩饰把它带回家。第二天，启人把基尔兽藏在公园然后上学，但是,基尔兽竟然偷偷地跟着启人的后面！基尔兽的出现令学校陷入恐慌。听见骚乱的启人，也拚命地寻找基尔兽，而基尔兽并不知道启人的心情而继续玩耍。这时，在启人面前出现个知道数码暴龙的神秘少年说启人没资格做驯兽师 启人受到伤害及信心尽失，但最后也被基尔兽的天真无邪所救回，启人及基尔兽一边跨越困难及一边逐步逐步地成为真正的朋友。但是在回公园的路上，基尔兽受到突然的攻击。袭击启人他们的就是妖狐兽及它的拍档留姬。

　　留姬单方面向启人宣战，虽然启人不允许战斗，但基尔兽竟无视启人的说话开始向妖狐兽反击。启人看到基尔兽的眼里仍然存有野生的光辉。因李健良的帮助而中断了战斗，但启人也因基尔兽露出斗争本能的样子而受到不少的冲击。留姬一口咬定数码暴龙是为了战斗而存在的，而李健良则视数码暴龙为朋友及重视它们。启人也因2方面的正反意见的考虑而烦恼，只怕会失去基尔兽。然后就在未知道答案前，在地下停车场，留姬又向启人宣战，李健良加入阻止2人的战斗，捲入战斗的大耳兽因受到攻击的冲击而进化成加鲁哥兽。失去理性的加鲁哥兽不断乱枪扫射，就连李健良也不能制止。而那个枪口正向着留姬对準，就在这千钧一髮的瞬间，基尔兽紧急地扑向加鲁哥兽而救了留姬。

　　虽然并没有发生危险的事情，但李健良的表情却很生硬。与启人天真无邪地憧憬进化相对照，李健良不允许大耳兽再次进化。第二日，正当李健良及大耳兽与启人一起回家时，在他们面前突然出现一片异常的雾。分开逃跑的启人去找基尔兽，那雾就算李健良他们逃到哪里也追到那里，简直就像生物捕捉猎物那样，然后就在李健良他们被追得走投无路的面前，一只数码暴龙终于实体化。它的样貌令李健良不由得吓得喘不过气来……那正是令他的内心深深残留着创伤的过去事件的主角--金刚兽！金刚兽袭击过来，大耳兽又不準许进化，后面赶到的启人和基尔兽也不断受到攻击。最后，李健良用卡片使大耳兽战胜了金刚兽。

　　在启人他们的学校最近竟然发生了不可思议的事情，操场上竟然有人用石灰胡乱涂鸦。犯人不明的这个事件成为了怪谈及加盐加醋地不断在师生间流传开去。再加上有传言指那与先前基尔兽的调皮是同一犯人所乾的更令启人坐立不安。不过在接着的星期日，犯人意外地弄清楚了。因要到白兔小屋值班而来到学校的启人，在操场的一角偶然找到的是古乐兽。原来那个涂鸦正是古乐兽为了和小朋友们一起玩耍而照着足球场的线所画的。启人与李健良商量后决定要为古乐兽找一个相称的拍档，在互相知道的人选中开始找寻候补，但是因他们的一长一短总也不能决定。到底启人他们能否平安无事地为古乐兽找到合适的拍档呢？还有在瞒着启人与古乐兽出外玩耍的基尔兽的面前新的数码暴龙也出现了。