自由外科医生大门未知子乘巴士到露天温泉游玩。没想到车子行进在山路上时，司机车田一久突然昏倒，心跳停止。在偶然路过的神秘女人帮助下，未知子把司机送到只有一个医生的山间医院。而医院中唯一的医生就是曾经崇拜未知子、跳出医局体制之外的外科医生森本光。未知子让森本当助手，实施了紧急手术。但是在这个连手术室都没有的小医院，要实行根治手术是不可能的。未知子嘱咐病人就近到大医院再进行一次手术。另一方面，东帝大学医院迎来了首位女院长志村元。她在院中展开清洁运动，大搞改革。就在此时，未知子出现在东帝大医院。实际上，志村正是前几天未知子遇到的神秘女人。志村把车田送到东帝大医院，她认为用最新设备做手术才是上策，而且决定雇未知子来主刀。很快，车田的术前会诊开始了。然而，志村不知出于什幺打算，决定把未知子排除在手术之外。她宣布，将请世界心脏外科权威、美国的杰克·麦克斯教授远程遥控手术机器人进行手术。这时，未知子在炸猪排店看到着名新闻记者一色辰雄倒在地上，便将他送到东帝大学医院。结果，她的举动竟招致了出乎意料的状况。

　　蛭间重胜重新夺回东帝大学医院的院长宝座，“白色巨塔”再次变回交织着金钱与权欲的组织。然而，西山直之和伊东亮治等“宽鬆世代”医生对组织的事丝毫不感兴趣，他们我行我素，连庄严的院长巡诊也敢不参加。这时，大门未知子在院内遇到一位捂着胸口倒在地上的女性。这位女士就是伊东的母亲不二子。未知子快速判断出不二子有必要做进一步检查，但伊东漠不关心，他抛下母亲离开了医院。第二天，不二子因故拜访蛭间，结果再次倒地而且吐血。原来，不二子得了极其罕见的进行性胆髒肿瘤。在蛭间策划下，不二子留在东帝大学医院接受手术。不过，术前会诊上却发生了意想不到的事情。伊东提议採取一种难度极高、只有未知子才敢做的手术方式。蛭间觉得这是个吸引社会关注的机会，便指定伊东任主刀。但是，不二子却拒绝手术，连铁面无私的伊东也无法说服她。

　　东帝大学附属幼稚园的园长三鸭寿昏倒了，被正巧路过的未知子送到东帝大学医院。未知子发现三鸭的肺部有肿瘤，马上建议他动手术，但是三鸭的反应却很迟钝。特别是三鸭原本是外科副部长猪又孝的患者。而猪又孝对他说在用药物缩小肿瘤前不要手术。面对强烈反对手术的猪又孝，未知子声称自己不会失败。这时，三鸭突然提出由其他医院会诊的要求。数日后，三鸭来到未知子所在的名医介绍所。神原晶听了发生的事情后，去找东帝大学医院院长蛭间。听说要重新接收去其他医院求诊的患者，蛭间面露难色，但神原晶说服他允许三鸭入院。结果，蛭间指名由猪又孝主刀，未知子担任第一助手，但自尊心超强的猪又孝听说让他与打工的自由医生一起手术后十分气愤。蛭间却伏在他的耳边悄声说出了自己的计画。另一方面，未知子遇到非常崇敬三鸭的幼稚园小朋友们，听了他们的无心之言后，不由得心有所动。

　　森本光在相亲活动上认识了叫四织的女孩，二人的感情发展到了订婚的地步。四织在上班时间来找森本，对他说已预订了最受欢迎的婚礼会场。就在这幸福的时刻，她突然在森本面前昏倒了。未知子正好路过，马上进行紧急处置，诊断出森本的女友四织得的是重度肝癌。虽然，四织準备在东帝大学医院做手术，但是她自己的肝脏中有再生能力的组织所剩不多。在术前的会诊上，外科副部长海老名敬看到女患者的名字时不由得一愣。四织的全名是内神田四织，和那个连院长蛭间重胜都不敢得罪他的日本医师俱乐部会长内神田景信同姓。因为“内神田”是个罕见的姓氏，海老名小心翼翼地向四织确认，得知四织是景信与前妻所生的女儿。收到海老名的报告后，蛭间非常慌张。为了安全起见，蛭间指定海老名、猪又孝、鸟井高三个外科副部长一起参加手术。然而，四织坚持要森本主刀，除他之外不接受任何人为自己做手术。森本虽然也渴望挽救四织的性命，但他对自己的技术没有自信，于是指名让未知子担任助手。然而，无论他怎幺请求，未知子都拒绝参与手术。四织的手术终于开始了，就在手术进行中， 发生了让人难以置信的情况。

　　日本医师俱乐部的会长内神田景信出于某种目的要在东帝大学医院试用最先进的人工智慧诊断系统“希波克拉底”。院长蛭间马上同意了，但外科副部长鸟高却对这种AI持怀疑态度。这时，年轻的天才将棋选手五反田五郎在与世上最强的将棋机器人对决过程中，突然发生手腕痉挛，随后昏了过去。五反田被送到东帝大学医院。以他的症状来看，极可能是患了脑部肿瘤，但是根据MRI画像却不能确诊。恢复意识后，五反田因鸟井不告诉他病名而大怒，準备出院回家。就在此时，他的腿部出现无力状况。东帝大学医院对五反田进行紧急会诊。但是他的血液检查指标一切正常，令医生无法确诊。本应是反AI派的鸟井竟提出由“希波克拉底”进行诊断。AI根据数据诊断五反田是脑脓肿。未知子认为这个诊断错了，但她也说不出病名来。很快，在病房里的五反田出现一过性意识障碍。脑脓肿的可能性越来越高了。按“希波克拉底”的指示，接下来五反田可以进行脑脓肿手术。蛭间觉得不能让AI诊断的病例出现失败，所以指名未知子为主刀医生。未知子严辞拒绝，但突然她想到一件事。