FY-3B卫星将与第一颗“风云三号”FY-3A卫星组网运行，由原来的一天全球扫描2次变为4次，从而提高对颱风、雷暴等灾害性天气的的观测能力。

除了天气预报外，“风云三号”B星还有监测乾旱、水灾、沙尘暴等自然灾害和生态环境、全球冰雪覆盖和臭氧分布以及区域空气品质的能力，甚至还能对全球粮食产量进行预估。

FY-3B卫星在卫星平台、有效载荷配置及主要功能性能指标上与FY-3A卫星并没有重大变化。但是作为新一代极轨气象卫星的首发星，A星在个别仪器的运行上还有些不足。经过气象卫星专家的技术总结与研製开发 FY-3B卫星在11个遥感探测仪器，尤其是红外分光计、微波成像仪和紫外臭氧垂直探测仪的功效发挥上更加完善。

此星发射成功并投入到实际业务使用中后，“风云三号”卫星将在数值天气预报、行星尺度天气分析、中小尺度天气预报、颱风定位与强度估算、地球生态与环境分析、全球气候变化的分析等套用领域中发挥更大的作用。

“风云三号”极轨气象卫星套用系统二期工程的建设目标是适当增加计算机资源，提高资料运算处理能力。在一期工程基础上，最佳化扩充和适应性改造已建的4个国内站、1个国外站和1个数据处理和服务中心的功能和性能，并完成全部业务及试验产品、监测分析服务，联合其它部门开展针对各领域的套用示範，使套用系统具有同时接收、处理和存储双星的资料。